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主要学习水产动物育种学、水产品品质与卫生检验、水环境科学、水族动物生产学等多门学科的基本理论和基本知识，受到专业相关学科基础研究和应用研究的科学思维和实验训练。

淡水养殖学其任务是通过了解养殖鱼类（包括水产经济动物）的生物学特性和各类养殖水体的水环境特点，掌握鱼类人工繁殖、育苗、养成以及鱼类资源增殖的基础理论、基本知识和基本技能。使学生能根据各类水域的特点，灵活应用所学的基本知识和基本技能，在保护环境和合理开发水产资源的基础上，提高各类养殖水域的生产力和经济效益。

水产动物遗传育种学是高等农业院校水产养殖学专业的一门重要专业基础课。本课程主要讲授动物遗传与变异的基本规律以及水产动物育种的基本原理和方法，将遗传学理论和水产动物育种技术结合起来，以遗传和变异为主线，遗传学理论主要包括遗传的物质基础、遗传信息的传递、遗传信息的改变、遗传的基本规律及其扩展、群体遗传学基础、数量遗传学基础、非孟德尔遗传等章节，相应拓展的水产动物育种的基本原理和方法主要包括选择育种、杂交育种、多倍体育种、基因定点突变技术、雌核发育与雄核发育、性别控制、细胞核移植、体细胞杂交和转基因鱼构建等内容。

水生生物学是水产养殖学专业的专业基础课，它着重讲述了与水域生态、养殖生产密切相关的小型浮游生物类群的形态特征及分类地位；同时介绍了这些生物类群在水体中所处的地位和作用。

动物遗传学是动物科学专业的一门专业基础课，主要介绍遗传学基本定律—孟德尔的分离定律和自由组合定律以及摩尔根的连锁互换定律，遗传的染色体理论，遗传的重要物质核酸的结构与功能，群体遗传结构中基因频率与基因型频率的概念以及遗传平衡定律—Hardy-Weinberg平衡理论、影响平衡的各种因素：选择、迁移、突变、遗传漂变等，数量性状的概念与主要遗传参数遗传力、遗传相关和重复力的概念及计算方法。目的是让学生了解遗传学的发展历史，掌握遗传学的基本知识和基本理论，理解分子遗传学的基本原理与研究方法，为后续课程的学习打下基础。

水产动物疾病学是研究水产经济动物病害发生发展的病因、致病机理、流行规律以及诊断技术、预防措施和治疗方法的科学。它是一门理论性和实践性都很强的学科，一方面，它要以免疫学、微生物学、生理学、组织学、寄生虫学、病理学、药理学、流行病学和水环境学等科学为基础；另一方面，它又要密切结合水产动物养殖生产实践，通过对水产动物病害的预防和治疗来建立并发展自己的学科体系。

水环境化学是环境化学的重要分支学科，主要研究天然水中各种元素、化合物（天然和人工合成）的形成、分布和循环过程，以及与其它环境介质的联系，鲜明地体现出地学和化学交叉的特色。地球水环境主要包括陆地水体和海洋水体，两者既存在密切联系，也存在显著差别。自全球工业化以来，人类活动对水环境的影响已远远超出大多数自然过程，各类污染物大量排放，水体是自然界中极其重要的接纳受体，对于污染物在不同空间尺度和时间范围内的迁移、转化、归趋以及密切相关的生物、生态效应（如致畸、致癌、致突变的三致效应和水生态毒理学变化等）具有举足轻重的作用。

微生物学是一门研究细菌、真菌和病毒等各类微生物的基础课程，主要介绍微生物的形态结构、繁殖方式、营养、代谢、生长特点、遗传变异，以及传染与免疫及其在工农业生产中的实际应用。

生物化学是研究生命过程中化学现象和机理的基础课程。主要内容包括氨基酸及其基本性质、蛋白质的结构与功能；核酸分子的结构与功能；糖和脂类的结构和功能；酶的分类、酶反应速度动力学和酶的催化机制；维生素和辅酶以及激素的功能；物质的跨膜运输、糖酵解、柠檬酸循环、三羧酸循环、电子转移与氧化磷酸化、糖原代谢、脂肪酸代谢、氨基酸代谢途径等。

本课程是海水养殖专业课。它主要研究各类饵料生物的生物学特点、营养成分及其培养技术。生物饵料具有营养丰富、大小适口、摄食方便、易于消化、保护水质等优点，故被广泛应用于海水养殖，尤其是各类苗种的繁育中。